Высшим органом управления Ассоциации является общее собрание членов Ассоциации, которое созывается по мере необходимости, но не реже одного раза в два года. Внеочередное общее собрание может быть созвано по требованию не менее одной трети членов Ассоциации, Ревизионной комиссии, Президиума Ассоциации.
О созыве и повестке дня общего собрания членов Ассоциации члены Ассоциации извещаются персонально не менее, чем за 15 дней до даты проведения собрания.

Президиум Ассоциации является постоянно действующим коллегиальным исполнительным органом управления Ассоциации. Президиум избирается общим собранием членов Ассоциации сроком на пять лет. Количество членов Президиума и его персональный состав определяется общим собранием членов Ассоциации.
Заседания Президиума Ассоциации проводятся по мере необходимости, но не реже одного раза в квартал. Заседание считается правомочным при наличии более половины его членов. Решение считается принятым, если за него проголосовало более половины членов Президиума.
Президиум Ассоциации принимает решения о наделении представителей Ассоциации полномочиями на ведение коллективных переговоров по подготовке, заключению и изменению соглашений, на участие в формировании и деятельности соответствующих комиссий по регулированию социально - трудовых отношений, примирительных комиссий, трудовом арбитраже по рассмотрению и разрешению коллективных трудовых споров.

Возглавляет Президиум Ассоциации Президент Ассоциации.

Контрольно-ревизионная комиссия избирается общим собранием Ассоциации сроком на пять лет.
Контрольно-ревизионная комиссия осуществляет контроль за исполнением решений общего собрания и правильностью расходования средств. Она избирает из своего состава председателя комиссии и секретаря.
Контрольно-ревизионная комиссия представляет отчет о своей работе общему собранию.
Председатель контрольно-ревизионной комиссии и ее члены имеют право присутствовать на заседаниях Президиума Ассоциации с правом совещательного голоса.

Исполнительная дирекция – постоянно действующий орган, создаваемый для текущего руководства деятельностью Ассоциации, выполнения решений общего собрания, Президиума Ассоциации, проведения экспертной и иной деятельности в соответствии с уставными целями Ассоциации и Положением об исполнительной дирекции. Исполнительная дирекция осуществляет полномочия, не отнесенных настоящим Уставом и действующим законодательством к компетенции Общего собрания членов Ассоциации, Президиума Ассоциации, Президента Ассоциации. Исполнительная дирекция подотчетна общему собранию членов Ассоциации и Президиуму Ассоциации. Руководителем исполнительной дирекции является исполнительный директор.